癌症表观遗传学:发现白血病关键蛋白
图1 蛋白质ENL对MLL-r白血病相当重要。1些白血病中存在着1些由部份MLL蛋白和另外一种蛋白的1部份混合而成的蛋白。第2种蛋白通常是SEC(super elongation complex)蛋白复合体或DotCom(DOT1L-containing complex)的1部份。这两种蛋白复合体都调理MLL-r白血病(完全和部份融会的SEC / DotCom复合体在图中以红色标出)中的基因转录程序。 ENL蛋白与两种复合物结合,同时在细胞中该复合体与MLL融会,ENL既能和未融会的SEC/DotCom互动,又能与融会的SEC/DotCom互动。ENL包括1个可以辨认组蛋白H3上的特定乙酰基(Ac)的YEATS结构域。Erb等人和Wan等人证实,ENL蛋白的 YEATS域有助于稳定SEC和DotCom与DNA的结合,增进驱动白血病方式的基因表达。
科学家们发现,调控蛋白ENL能增进白血病的产生。这加深了学界对转录调控的理解,并提示了1种潜伏的白血病疗法。
血液肿瘤的病发缘由通常是染色体易位,产生由两个蛋白质的片断连接构成的融会蛋白,终究引发疾病。调理蛋白混合性白血病(regulatory protein mixed lineage leukaemia, MLL)中的融会蛋白通常也存在于侵袭性儿童白血病中,并且与不良预后有关。因此,开发基于MLL重排(MLL-rearranged, MLL-r)融会蛋白的白血病医治策略非常必要。在《自然》(Nature)杂志中,Erb等人he Wan等人指出,ENL蛋白是影响白血病中MLL-r细胞存活能力的关键因素。
细胞中包裹DNA的组蛋白是结构和信号因子。添加或去除组蛋白上的份子基团修饰,可以调理基因表达。 ENL蛋白的1个明显结构特点是具有1个由大约75个氨基酸折叠而成的结构域——YEATS结构域。该结构可以读取组蛋白上的乙酰化修饰——机制是辨认和结合组蛋白中有乙酰基修饰的赖氨酸残基。Erb等人和Wan 等人提供的证据非常扎实,表明ENL对乙酰化组蛋白的这类“读取”能力对引诱MLL-r白血病相当重要。
MLL融会蛋白主要是触及表观遗传调控(独立于DNA序列的基因表达调理方式)的两个蛋白复合物。第1个是SEC(super elongation complex, SEC),其增进转录延伸的基因转录阶段。第2种是DotCom(DOT1L-containing complex, DotCom),其将甲基添加到组蛋白H3上的赖氨酸79残基(缩写为H3K79)。产生这些融会的染色体易位通常产生在哺乳动物中两组染色体中的1组上。
普遍的观点是MLL融会蛋白增进SEC和DotCom,和两条易位染色体编码的其它蛋白(包括融会和正常非融会蛋白)定位到它们增进表达的基因处,从而增进白血病产生。
Erb等人和Wan等人发现了SEC和DotCom稳定性的另外一个互补机制。他们发现,ENL的失活削弱了MLL-r细胞中SEC和DotCom的功能。ENL与SEC、DotCom结合的能力提示了1种模型——ENL通过YEATS结构域,辨认乙酰化H3,增强SEC和DotCom复合体与DNA结合的稳定性,并调理基因组异常区域的活性(图1)。
这类新模型提出了1种可能性,靶向ENL YEATS结构域的小份子抑制剂等药物可以选择性杀死白血病MLL-r细胞。其它细胞类型仿佛可以很大程度上地耐受ENL损失,但是SEC、DotCom和ENL在多种细胞中均有表达,所以在开发这类药物时,非常重要的1点就是要理解这类耐受性上的差异。
在MLL-r白血病中,ENL的重要性与多项研究1致。这些研究显示,DOT1L活力调控不良是MLL-r细胞的存活和增殖所必须的。长时间以来,H3K79甲基化1直与基因转录活力相干,并且是控制DOT1L活性的调理机制。1个关键的未获解答的问题是,这些组蛋白修饰是如何直接影响转录的。
甲基—赖氨酸信号通常通过与YEATS结构域读取甲基化修饰类似的机制,与下游进程相偶联。除H3K79外,所有主要组蛋白甲基化位点的浏览器结构域都已被辨认。另外,甲基化赖氨酸可以通过脱甲基酶来动态调理,但是去除H3K79处甲基的脱甲基酶还有待鉴定。Erb等人和Wan等人的研究进1步鼓励了研究人员去辨认和鉴定H3K79甲基化的“读取器”和脱甲基酶,由于这些酶与ENL介导的信号通路交叉,也可能成为MLL-r白血病的医治靶点。
目前有1种新的理论认为,表观遗传调理因子可以在疾病中发挥重要作用。在这类意识的驱动下,愈来愈多的学者和企业致力于开发这些机制的抑制剂来医治癌症。已有MLL-r白血病的临床实验评估了DOT1L抑制剂(详见go.nature.com/2lquysj)。有趣的是,Erb等人发现,在细胞模型中,使用DOT1L抑制剂,外加敲入不能辨认乙酰化赖氨酸的ENL突变基因,相比于单用这两种方法,抑制驱动白血病产生的基因表达程序的效果更强。这表明,这两种疗法之间存在协同作用。
Wan等人还研究了组合疗法医治MLL-r白血病的潜力,联用靶向ENL YEATS结构域和赖氨酸乙酰化的另外一个读取器—BET家族蛋白的溴结构域。BET蛋白通常与SEC相互作用。并增进转录延伸。BET抑制剂破坏了BET蛋白与乙酰基—赖氨酸部份的结合,并且目前有约20个临床实验测试这些药物在癌症医治上的功效。Wan等人发现,ENL YEATS结构域的抑抑制剂与BET抑制剂JQ1的联用,对MLL-r白血病细胞具有高度毒性。
这些组合疗法的效果表明,多个组蛋白修饰信号共同作用,构成MLL-r白血病的特有表观遗传状态。因此,多头靶向疗法的疗效更强,且可减少耐药性的出现——这是单药物疗法的风险之1。
1直以来,药物开发者主要聚焦于靶向酶活性,而非蛋白质—蛋白质相互作用。但是,靶向多个表观修饰基团“读取器”疗法的开发变得愈来愈流行,这部份得益于BET抑制剂获得的成功。YEATS结构域的结合位点也是1个非常有吸引力的药物开发靶标。因此,Erb等人和Wan等人关于ENL的发现不但加深了我们对细胞如何整合与转录像关的信号的理解,而且为医治复杂疾病提供了新的启示。
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