奕真生物联手Fabric Genomics 推动个人全基因组测序市场普及
作者: 周梦亚
近日,动脉网(微信:vcbeat)获悉,全球基因测序和解读服务领导者Veritas Genetics(奕真生物)与基因组学数据服务商Fabric Genomics在ACMG年度临床遗传大会上宣布重磅消息:两家公司目前已达成合作,将利用Fabric Genomics的全新快速基因数据注释解决方案Annotation,进一步推进奕真生物的个人全基因组测序产品myGenome的市场普及。
奕真生物大家应该比较熟悉,动脉网也曾有过相关报道。这家哈佛系的基因公司成立于2014年,由诺贝尔奖得主(2016)、个人基因组学先驱George Church ,以及他的学生哈佛大学医学博士Preston Estep ,生物科学企业家Mirza Cifric ,以及华人青年科学家赵奕宁共同创立,希望通过遗传筛查和基因测序手段,改善人类的生活和健康质量。2016年,公司上榜MIT的“全球最聪明的50家公司”榜单。
2016年下半年,奕真生物推出了个人全基因组测序产品myGenome,这也是全球首个1000美金以下的个人全基因组测序产品。除了基因测序,公司还提供基因注释以及电话遗传咨询服务。2016年7月,公司在中国成立了办事处。紧接着又在10月份获得了来自礼来亚洲、挚信资本以及先声药业的B轮融资,融资金额3000万美金。
另一家公司Fabric Genomics同样是全球基因组学领域的佼佼者。Fabric Genomics总部位于奥克兰,是一家基因组学数据分析公司,为临床和医院实验室、国家测序项目和生命科学公司提供端到端的基因组学数据分析、注释、管理和报告解读服务。
2009年,Martin Reese, Edward Kiruluta, John Stuelpnagel三人成立了Fabric Genomics前身Omicia。这家公司作为主要的基因组学和临床报告解读服务商,参与了英国2013年的10万人基因组计划。截止到2016年,Omicia融资总额已超过3000万美金。2017年3月,Omicia正式更名为Fabric Genomics,并推出基因组数据分析平台。
该公司分析技术始于原始数据分析,可允许任何NGS文件(比如FASTQ、BAM 、VCF)输入,可快速而高效的对高通量Panel、外显子以及全基因组数据做出注释,同时可对临床提供遗传疾病和肿瘤报告的遗传咨询服务。目前,Fabric Genomics的前沿数据方案已被全球超过1000家学术机构和临床实验室使用。
Annotation是Fabric Genomics最新推出的基因注释解决方案。通过将基因组学和其他组学的深度整合,可对数据进行多维度的分析预判,同时平台还整合了大量的文献资源。通过Fabric Annotation,实验人员可对Panel、外显子以及全基因组进行自动化的注释操作。同时,为了保证数据的全面性和前沿性,Fabric Genomics每个月都会进行数据更新。
目前,奕真生物myGenome所使用的就是Fabric Genomics的Annotation。该平台最低可将全基因组注释降低到10分钟以内,极大的降低了测序的时间成本。Fabric Genomics CEO Matt Tindall表示:“全基因组与基因注释结合,myGenome将会有新的突破。”
奕真生物生物信息带头人Diego Martinez认为:“Fabric Genomics的自动化注释可以帮助我们实现工作流程的无缝对接。简洁而高效,他们让复杂的数据清洗和分析变得容易和有趣,是位了不起的合作伙伴。”
奕真生物一直以个人全基因组为核心和方向,Fabric Genomics在数据分析环节的优势恰好与之形成互补。Diego Martinez透露,Fabric Genomics的技术可帮助他们节省大量人力和时间,通过此次合作他们将建立更紧密的联系。
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